Los mejores años del Villarreal fueron con Juan Román Riquelme en cancha. Por ello, no es extraño que haya sido reconocido como el mejor futbolista de su historia, tras una encuesta realizada por un medio español.

Su salida de Boca al Barcelona le abría su camino al fútbol europeo. Sin embargo, diferencias con el entrenador Louis Van Gaal lo marginaron del primer equipo. Así, recayó en el Villarreal, sin pensar en todo lo que lograría con este club.

De 2003 a 2006, Riquelme fue la figura del "Submarino amarillo". Consiguió dos Copas Intertoto y logró llevar al equipo hasta la semifinal de la UEFA Champions League, aunque falló el penal decisivo ante Arsenal en esa instancia. Poco importa eso.

Así compuso su idolatría Juan Román Riquelme. Así también se lo reconoce el propio diario Marca tras una encuesta donde también se eligió el mejor "once" de la historia del club de Castellón.

En ese equipo figuran otros dos futbolistas argentinos como Rodolfo Arruabarrena y Mateo Musacchio. También resaltan los uruguayos Diego Godín y Diego Forlán. En tanto, en el banco de suplentes, quedaron Gonzalo Rodríguez y Martín Palermo. Al frente de este equipo, el mejor entrenador de la historia del Villarreal, el chileno Manuel Pellegrini.